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            國際前沿科技

            23個癌癥類型,10000+個腫瘤樣本綜合分析,指導腫瘤免疫療法

            2016-09-01

            來源:轉化醫學網 2016-08-25 11:24

            Li Bo等開發了一種計算方法來研究腫瘤浸潤免疫細胞以及它們與癌細胞之間的相互作用。他們關于免疫滲透水平,臨床關聯以及預測標志物等方面的數據可能預示產生有效的癌癥疫苗和檢查點抑制療法。相關實驗發表在Genome Biology。

            圖1. 預測腫瘤浸潤淋巴細胞豐富性的計算方法

            最近,癌癥免疫治療在晚期腫瘤方面取得了顯著成功,但仍有很大一部分患者治療效果不明顯。大家努力闡明腫瘤與免疫的相互作用,并提供治療效果的預測。Rooney等通過使用兩種效應分子的表達水平來研究細胞毒活性(CYT),并確認免疫逃避機制。近期有人成功分析了大腸癌的免疫表型,而且提供了新的治療靶點。雖然這些研究很大地提高了人們對于腫瘤免疫編輯的理解,但對于腫瘤和免疫系統之間的相互作用以及其如何影響患者治療效果,我們知之甚少。腫瘤浸潤免疫細胞的臨床研究已經確立了細胞毒性T細胞(CTL)和腫瘤相關巨噬細胞(TAMs)在一些疾病中的作用。然而,許多癌癥中其他免疫細胞臨床效果,我們仍然不知道。因此,我們要更全面地分析腫瘤免疫性,來理解多組分的抗腫瘤反應和引導有效的抗腫瘤免疫療法。

            圖2. 浸潤淋巴細胞的分布和腫瘤微環境中B細胞的特異性增強

            Li Bo等整合了來自23個癌癥類型,超過10000個腫瘤樣本的分子序列,來調查個人的免疫組分對于綜合臨床表現的影響。他們通過多種方法,包括計算機模擬、正交比較和病理學方法,驗證他們對于腫瘤浸潤免疫細胞的推測。通過將免疫浸潤與病人療效關聯,他們確認了一些新的聯系,包括新的聯系和以前的研究所支持的聯系。他們的分析還表明,免疫浸潤腫瘤的異質性是由潛在的癌癥遺傳變異以及趨化因子/受體的特異性表達引起的。另外,他們研究了治療性癌癥疫苗和檢查點抑制的免疫治療靶點。最后,他們相關的調查結果已經打包上傳到TIMER(腫瘤免疫評估資源),從而進一步探索腫瘤微環境中的不同免疫浸潤對于特定疾病的臨床影響。

            圖3. 免疫細胞浸潤預測臨床效果

            了解腫瘤與免疫系統之間的聯系對于發現生物標記物,減少多藥耐藥以及開發新的療法是至關重要的。所以,我們需要新型的計算方法來評估腫瘤浸潤免疫細胞以及理解癌癥中腫瘤與免疫之間的關系。

            圖4. 腫瘤間免疫浸潤基因異質性的潛在原因

            他們在來自癌癥基因圖譜(TCGA)的23種癌癥類型的10000份以上的RNA測序樣品中,分析腫瘤浸潤免疫細胞。相比其他方法而言,他們的計算方法推斷的免疫浸潤與患者臨床特征、病毒感染和癌癥的遺傳改變狀態更相近。腫瘤/睪丸抗原表達與CD8 T細胞豐富表明MAGEA3是黑色素瘤(而不是非小細胞肺癌)的一個潛在的免疫靶標,這暗示著SPAG5可作為多種癌癥的替代癌癥疫苗的靶標。他們發現高表達CTLA4的黑色素瘤在CD8 T細胞浸潤方面,可以分為兩個不同的群體,CD8 T細胞浸潤可能影響抗CTLA4藥物的臨床反應。他們觀察到,關于腎細胞癌CD8 T細胞,Tim3表達也存在上述的區分。豐富的免疫浸潤以及他們的下游分析結果,可通過TIMER來獲得(http://cistrome.org/timer)。

            圖5. 非小細胞肺癌和黑色素瘤中免疫細胞浸潤和癌癥/睪丸(CT)抗原表達之間的聯系。

            圖6. 高表達抑制性受體的腫瘤中CD 8 T細胞浸潤水平

            參考文獻Comprehensive analyses of tumor immunity: implications for cancer immunotherapy.(力太生物.com)


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